牛文元提出，应由国家发改委、工信部、交通运输部、铁道部、城乡建设部、环境保护部、科技部等组成跨部门轮值机构，共同制定出覆盖工业、交通、建筑三大高耗能领域和中国50个最大城市的“低碳发展国家行动方案”，设计相应的调控总量和约束性细则，形成一个具有国家意志的低碳发展蓝图，并作为国家“十二五”规划执行附件，成为地方政府政绩考核的重要内容之一。

　　牛文元建议，跨部门轮值机构要下决心对中国规模以上企业和50个最大城市分行业、分类型、分产品进行一次基底详查，制定相应的“碳源碳汇平衡表”，形成以2010年为基础年的中国“碳足迹”档案。在此基础上，建立“国家碳补偿制度”，努力增加碳汇，加大对气候友好产业扶持力度，设立具有中国特色的“碳交易”模式和碳定额管理制度。同时，积极推动低碳开发、低碳管理、低碳技术、低碳消费等一揽子政策法规建设，形成有效的法律体系，促进中国经济低碳发展。