鄱阳湖在生态环保体系建设方面，主要以湖体保护、滨湖控制、生态廊道建设为重点，统筹湖区及流域上下游、干支流的生态建设和环境保护。为此，江西省将实施长江暨鄱阳湖源头水资源生态保护工程、造林绿化“一大四小”工程、鄱阳湖湿地保护与恢复工程、五河源头保护工程、鄱阳湖水资源保护工程等。其中，到2015年，恢复湿地植被60万亩，治理五河入湖口湿地30万亩，建设20个国家级湿地公园，60个省级湿地公园，鄱阳湖天然湿地面积保持3100平方公里。鄱阳湖水功能区达标率达到90%以上，水质常年要稳定在Ⅲ类以上。